Las dismenorreas funcionales están relacionadas con el aumento y la posterior caída de la progesterona en la fase lútea. Se han observado concentraciones elevadas de prostaglandinas F2 (PGF2) y de leucotrienos, en el flujo menstrual y en las biopsias de endometrio de mujeres con dismenorrea, en comparación con mujeres con amenorrea. El aumento de PG causa contracciones uterinas que restringen el flujo sanguíneo y conducen a la producción de metabolitos que estimulan los receptores del dolor.